可可托海地势东高西低，地貌地形复杂多样，动植物种类繁多，自然景观极其丰富，这里雪峰与碧水辉映，边疆民族风情色彩斑斓，旅游内容十分独特，丰富多姿，中国的唯一 一条北冰洋水系的外流河,额尔齐斯河自东向西穿城而过，这里雨量充沛，水资源丰富，其中国家级著名工程635工程，即引额尔齐斯河水，一期济克拉玛依市，二期济乌鲁木齐市的工程区就位于额尔齐斯河的上游区段。
　　可可托海至今仍保留着1936年苏尔提地震断裂带和喀拉先格尔地震断裂带，上下落差达数十米,尉为壮观。山区森林资源得天独厚，林区内森林覆盖率达32.5%，主要树种为西伯利亚云彬， 西伯利亚落叶松，疣枝桦，欧洲山杨等阔叶树种，面积是全新疆及至全国最大的山区林场，林区内活立木总蓄量400余万立方米，其天然林保护工程区内共有978个林班，林区生态作用十分明显，特别是涵养水源，调解流量，保土防洪作用十分明显，林区森林还是准噶尔盆地北部的绿色屏障。